Nasceu em Baku, Azerbaijão. Estudou na Academia de Cinema de Sarajevo com o aclamado cineasta húngaro Béla Tarr antes de fazer sua estreia com o longa Hills without Names (2018). Baydarov completou uma premiada trilogia de documentários ambientados em Katech, no Azerbaijão: When the Persimmons Grew (2019), que ganhou a Menção Especial do Júri do festival Visions du Réel, Mother and Son (2019) e Nails in My Brain (2020), que estreou no Cinema du Réel.